System lub rozkład dostosowany do potrzeb
Taką zmianą może być wprowadzenie systemu równoważnego czy zadaniowego czasu pracy. Choć ustawa nie mówi o tym wprost, to jej cel prowadzi do wniosku, że pracodawca może wprowadzić takie zmiany jednostronnie, z pominięciem zasad i ograniczeń wynikających z kodeksu pracy. Nie musi zatem zmieniać funkcjonującego w zakładzie układu zbiorowego pracy czy regulaminu wynagradzania, uzgadniać zmian ze związkami zawodowymi lub przedstawicielami pracowników czy zawierać z pracownikami indywidualnych porozumień.
Zmiany systemów czy rozkładów czasu pracy mogą wejść w życie natychmiast po ich zakomunikowaniu pracownikom. Wprowadzenie zmian może przyjąć formę obwieszczenia lub polecenia, najlepiej w formie e-mailowej lub pisemnej. Pracodawca powinien zakomunikować pracownikom przyczyny ich wprowadzenia.
Praca w nadgodzinach ponad limity
Drugim szczególnym uprawnieniem pracodawcy jest możliwość polecenia pracownikom świadczenia pracy w godzinach nadliczbowych w zakresie i wymiarze niezbędnym dla zapewnienia ciągłości funkcjonowania zakładu. Również w tym przypadku ustawa jest lakoniczna i konieczne jest jej rozwinięcie z uwzględnieniem celu jej wprowadzenia.
Tak więc praca w godzinach nadliczbowych na tej podstawie nie powinna być ograniczona rocznym czy dziennym limitem godzin nadliczbowych wynikającym z kodeksu pracy, układu zbiorowego lub regulaminu pracy. Ze względów bezpieczeństwa pracodawca powinien jednak przestrzegać kodeksowych regulacji dotyczących minimalnego nieprzerwanego odpoczynku dobowego i tygodniowego pracowników.
Polecenie pracy w godzinach nadliczbowych na podstawie ustawy powinno wskazywać na konieczność zapewnienia przez pracodawcę ciągłości działania przedsiębiorstwa.
Odmowa lub przesunięcie urlopu
W ramach zmian w organizacji pracy na podstawie ustawy pracodawca może odmówić pracownikowi udzielenia urlopu wypoczynkowego, urlopu na żądanie, urlopu bezpłatnego i innych urlopów. Może także jednostronnie przesunąć termin takiego urlopu lub odwołać go, jeżeli już go pracownikowi udzielił. Z oczywistych powodów te szczególne uprawnienia pracodawcy nie dotyczą urlopu macierzyńskiego, rodzicielskiego oraz wychowawczego.